皮膚浸泡在水中的時間越久，感染皮膚病的機會就會增高，因為泡水太久，作為皮膚屏障的角質層越容易出現松懈，很容易受到病毒和細菌的侵害，而大多數公共泳池并不會很經常地換水，因此很容易感染真菌性皮膚病，如體癬、足癬、水猴子等。

游泳池里的水常用漂白粉消毒，漂白粉有輕度刺激性，游泳后雙眼容易出現輕微的發紅癥狀，往往在數十分鐘后會自行消失。但很多游泳池不需要健康證即可入場，如果和一些患上沙眼、紅眼病的人一池游泳，病原體會通過池水傳染，健康的人也可能會然上此類疾病。

游泳時，若耳道里有耵聹（即平時所說的耳屎），耵聹遇水泡脹后就會腐蝕耳道皮膚，或耳道有濕疹也易引發中耳炎。

游泳的水中可能潛伏一些會引起腹瀉的細菌，包括隱孢子蟲、藍氏賈第鞭毛蟲、志賀氏菌屬和大腸桿菌等。游泳時如果不小心喝了泳池的水，則可能會發生腹瀉，但腹瀉不一定會在游泳當天馬上出現，有時甚至在游泳1－2周后出現。